Полезная нагрузка необходима для придания космическому аппарату практической и научной ценности.

Модуль ПН YktSat EDU/16 - плата с кластером из 16 микроконтроллеров ATmega328PB. ПН состоит из набора плат, включающего основную плату-адаптер и 16 напаиваемых плат с микроконтроллерами ATmega328PB-16MU. Платы с микроконтроллерами устанавливаются на основную плату-адаптер, обеспечивающую электрические интерфейсы для подключения к общей шине КА и механические интерфейсы для интеграции с платформой. Возможна установка дополнительного модуля детектора частиц.

Кластер разделен на 2 подгруппы по 8 микроконтроллеров, каждая подгруппа подключена к одному управляющему контроллеру ATmega128A-16AU. Управляющий контроллер (супервизор) обеспечивает связь микроконтроллеров кластера с бортовой шиной.

На каждый из микроконтроллеров кластера с помощью супервизора можно загрузить ПО, разработанное пользователями. Через супервизор контроллеры могут получать данные с бортовых датчиков, выполнять обработку данных по собственным алгоритмам, передавать данные на наземную станцию. Супервизор также сохраняет результаты работы ПО пользователей во время полета КА вне зоны действия наземных станций.